freesurfer+matrix3+fsl安装配置

Ubuntu虚拟机

## 安装freesurfer参考:
https://blog.csdn.net/uinglin/article/details/79541063
Linux平台安装官方教程：https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki//FS7_linux

PS：在获取license时我翻墙才获得，不翻墙在提交时注册不了，因为刷不出来“I am not a robot"的验证图片。
将下载的license.txt 放到freesurfer文件夹中。

在~/.bashrc文件中添加
$ export FREESURFER_HOME=$HOME/freesurfer
$ source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
这样每次使用source ~/.bashrc命令使环境变量生效

## 安装matrix3可以参考：
https://mrtrix.readthedocs.io/en/latest/installation/build_from_source.html#install-dependencies

mrtix3问题1：./configure
/usr/bin/env: ‘python’: No such file or directory
解决：因为我安装的是python3，可以安装python2，也可以使用命令：
python3 configure
python3 build

## fsl安装参考：
https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation/Linux