lammps基础教程:Ovito标记原子内部运动方法介绍

大家好,我是小马老师。
Lammps模拟完成后,一般需要进行图像后处理,因为lammps不带后处理功能,这些图像后处理需要借助第三方软件实现,比如vmd、ovito等。
本文主要介绍在Ovito中如何标记原子的内部运动。
比如,在下面的剪切模拟中,中间部分原子被标记为绿色,在后续的剪切过程中,可以明显地观察到这些原子的运动轨迹。
在这里插入图片描述

下面介绍一下具体实现的过程。

  1. 导入数据文件
    打开Ovito软件,导入dump.xyz轨迹文件,如下图所示。
    在这里插入图片描述

  2. 选择中间原子
    点击Ovito右上角菜单“Add modification”,选择“Expression selection”

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