那就不分析吧,放弃吧。
当然,如果有在线的就好了,省得抄写代码,焦急的等待。
推荐几个省力的地方。(不要问我怎么发现的,就是懒,加上网不是太好,下载不了tcga数据,总要搞点事情)
简述下来,就一句话,可以分析一些基因,乃至一个参与同一通路的基因集,在不同肿瘤里的表达和预后,并且可以分析这个表达是不是和性别、病程发展相关。使用教程
- 拿TCGA肝癌的RNA-Seq数据来做差异分析例子
需要下载一个软件,TCGA简易下载工具
但是由于我TCGA数据现在下载不了,可能和网络有关,我这个方法测试成。
3.UCSC xena 浏览器
这里面有很多的DATABASE,但是,分析出来的结果真的不是太明朗。包括一个肿瘤的database,可能会有很多,总觉得拿出去展示不太好,总感觉大的项目加载时间长,分析项目多,勾选处多,个人不喜欢。