利用Seurat包入门生物信息学(part2)--引导案例之PBMC聚类

学习笔记，仅供参考，有错必纠
参考资料：https://satijalab.org/seurat/index.html；
备注：这是我第一次学习的笔记，对此了解更深入之后，会重新整理

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Seurat Package

在本教程中，我们将分析10X Genomics公司免费提供的外周血单核细胞(PBMC)数据集，该数据集包含2,700个单细胞在Illumina NextSeq 500上的测序信息. 原始数据指路:Peripheral Blood Mononuclear Cells;

加载包

加载Seurat包及其他需要使用的包.

library(Seurat)
library(dplyr)
library(patchwork)

查看Seurat包的版本信息.

packageVersion("Seurat")

[1] ‘4.1.1’

读取数据

用Read10X()方法读取文件，该方法可以便捷的获取由10X genomics提供的稀疏数据矩阵.

Read10X(
  data.dir,
  gene.column = 2,
  cell.column =