群体遗传进化专题之选择性清除分析

本文介绍了选择性清除的概念及其在物种进化和驯化研究中的应用,通过FST、CLR、GWAS等方法揭示基因选择信号。在李子、江豚、芥菜和苹果的案例中,分析了选择清除如何影响基因多态性和物种适应性,揭示了关键基因在重要性状驯化中的作用。
摘要由CSDN通过智能技术生成

所谓选择性清除:当一个有利突变发生后,这个突变基因的适合度越高,就越容易被选择固定。当这个基因被快速固定之后,与此基因座连锁的染色体区域,由于搭车效应也被固定下来,大片紧密连锁的染色体区域因此失去多态性,这种由于搭车效应引起多态性下降的现象,遗传上称为选择清除。

下图可以形象的展示受选择后的结果。

image.png

圈子不同,别瞎凑合。

二、来看看都有哪些形式的选择清除结果展示

1、FST挖掘人工驯化过程中受选择的基因–74份中国李核心种质可聚类为南、北、东北及国外品种群,南方品种群较为原始,遗传多样性丰富,且与其他品种群间存在基因交流,推测中国李起源于我国南方长江流域。不同品种群间进行选择压分析,共鉴定到35个受选择位点,其中,开花调控、抗病抗逆及类黄酮代谢等重要途径关键基因显著富集,初步揭示了中国李重要性状驯化的分子基础。

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纵坐标如Fst(F_S),表示该结果是F群体与S群体间的分化指数,这里对FST做了一个Z变换,所以数值范围不是[0~1],但值越大也是分化越显著区域。图上可直观看到分化指数较高的位置。

2、挖掘物种适应性进化中受选择的基因–野外收集到的各亚种间在遗传物质上有何差异,不妨来看看借助选择性清除探究“只有长江江豚可以在淡水中生活的奥秘”?

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