派森诺细菌完成图标准分析+高级分析

最新推荐文章于 2024-10-07 00:05:15 发布

菌小落

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本文链接：https://blog.csdn.net/muhamuha2020/article/details/121426491

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本研究通过对腹泻仔猪肠道中分离的产气荚膜梭菌JXJA17进行全基因组测序和分析，发现其携带的典型β2毒素与致病性相关。通过对菌株的基因组特征、毒力和耐药基因分析，为理解β2毒素在仔猪腹泻中的作用提供了基因组学依据。

摘要由CSDN通过智能技术生成

派森诺与江西农业大学张锦华老师课题组合作，在微生物基因组领域的《Scientific Reports》发表研究成果！该研究从腹泻仔猪的肠道内容物中分离得到了一株A型的产气荚膜梭菌JXJA17，对其进行了全基因组测序和比较基因组分析，为进一步研究β2毒素与仔猪腹泻的关系提供了依据。

01、研究背景

产气荚膜梭菌（C. perfringens，Cp）是一种普遍存在的革兰氏阳性杆状厌氧细菌，根据其产生的四种毒素，将其分为A-F七种类型。Cp是人类和动物的常见病原体，是一种条件致病菌，会导致气体坏疽、腹泻和食物中毒等疾病发生，并生成相关的毒素和毒力因子（A-F型的Cp产生的毒素超过18种）。CpA主要由两个cpb2等位基因编码产生α毒素和β2毒素（β2毒素分为两类：典型和非典型），而典型β2毒素被认为和从猪上分离得到的C. perfringens有关，但是关于CpA β2毒素的发病机制及CpA的全基因组研究较少。

本研究从腹泻仔猪的肠道内容物中分离得到229株Cp，经毒素分型鉴定为CpA。根据小鼠毒性实验和兔子回肠实验发现，该菌株携带cpb2基因，且比不携带cpb2基因的健康仔猪分离到的CpA具有更高的致病性。为了更好地鉴定腹泻仔猪CpA的β2毒素，故对C. perfringens JXJA17菌株进行了全基因组测序，并对cpb2基因进行了分析。

02、研究材料与方法

1.实验材料：腹泻仔猪的肠道内容物中分离得到的A型C. perfringensJXJA17菌株

2.测序平台：Illumina Miseq+Pacbio

3.分析内容：细菌完成图测序、毒力和耐药基因分析、进化树构建、共线性分析

03、研究结果

1.菌株JXJA17的基因组特征