派森诺细菌完成图+转录组+蛋白组+实验端验证高分文章

微生物基因组多组学联合分析又双叒叕添高分文章啦！

近日，派森诺生物与四川师范大学生命科学院赵甲元老师课题组携手，在微生物基因组领域的《Chemical Engineering Journal》发表研究成果！依旧是经典的细菌完成图测序+转录组测序+蛋白组测序+实验端验证的研究思路，每有文章刊载必是精品，还在等什么，快来get吧！

01、研究背景
农药在保障粮食安全方面发挥着重要作用，但对食品安全、生态保护和人类健康构成潜在威胁。通过微生物活性降解农药，作为一种安全、环境友好、实用的消除农药残留的方法，越来越受到人们的关注。虽然已经从环境中分离出许多拟除虫菊酯（一种农药）降解微生物，并提出了几种降解途径，但总体而言，编码拟除虫菊酯及其代谢产物降解酶的基因仍有待研究。拟除虫菊酯通常被认为是比毒性更强的有机氯和有机磷农药更环保的替代品，其中β-氯氰菊酯（β-CY）占全国拟除虫菊酯市场的50%以上。由于过量喷洒，β-CY残留在水果和蔬菜、河流和土壤中均被检测到，这可能对人类和环境建库产生长期影响。本研究旨在研究从绵羊瘤胃食糜中分离的一种细菌GW-01（蜡样芽孢杆菌）降解β-CY的相关酶基因以及代谢途径。

02、研究材料与方法

1.实验思路

2.实验材料：

从甘肃武威市的5岁健康雌性小尾寒羊的瘤胃糜样品中，通过共代谢分离得到β-CY降解菌株——蜡样芽孢杆菌GW-01菌株。

3.测序平台：

Illumina Miseq+Pacbio 、 Illumina HiSeq X Ten。

4.分析内容：

菌株形态和生理生化鉴定、细菌完成图测序、转录组测序、蛋白组测序、代谢组产物检测、基因克隆、载体构建及酶形态学分析等等。

03、研究结果

1.GW-01菌株的特性分析

显微镜观察显示菌株GW-01是一个革兰氏阳性杆状菌，在光镜下产生出的孢子呈现圆形或柱状的中生或亚中生孢子。在37℃的LB培养基上孵育24h后，形成圆形或近圆形、柔软、无色素、直径在5-7mm、微亮的白色菌落（图1）。

图1：菌株GW-01革兰氏染色反应(a)、孢子染色(b)、LB琼脂平板菌落形态©、血平板菌落形态(d)。

基于16S rRNA系统发育树分析表明，菌株GW-01与Bacillus albus MCCC 1A02146, Bacillus luti MCCC 1A00359, Bacillus nitratireducens MCCC 1A00732和