（精确度，召回率，真阳性，假阳性）ACC、敏感性、特异性等 ROC指标

1、概念

	金标准（标准集）
预测算法（预测集）		验证存在（T）	验证不存在（F）	合计
	预测存在（P）	预测为正，真实为正（TP）	预测为正，真实为负（FP）	P（预测为正样本）
	预测不存在（N）	预测为负，真实为正（FN）	预测为负，真实为负（TN）	N（预测为负样本）
	合计	T（验证为正样本）	F（验证为负样本）	所有样本数（P+N或者T+F）

简化后：

	标准集
测试集		正样本	负样本	合计
	预测正样本	TP	FP	P
	预测负样本	FN	TN	N
	合计	T	F	P+N或者T+F

准确率（Accuracy）：Acc = ( TP + TN ) / ( P +N )

精确率( precision )/（查准率）：TP / ( TP+FP ) = TP / P  

敏感性(Sensitivity)/召回率（recall）/（查全率）：TP / (TP + FN ) = TP / T

真阳性率（True positive rate）：TPR = TP / ( TP+FN ) = TP / T  （敏感性 sensitivity）

真阴性率（TNR：true negative rate）：TNR= TN / (TN+FP) = TN/F（特异性：specificity），描述识别出的负例占所有负例的比例 

假阳性率（False positive rate）：FPR = FP / ( FP + TN ) = FP / F  

假阴性率 (False Negative Rate）：FNR = FN /（TP + FN）= FN / T

F-measure：2*recall*precision / ( recall + precision )

ROC曲线：FPR为横坐标，TPR为纵坐标

PR曲线：recall为横坐标，precision 为纵坐标

=====概念解释=============

敏感性 Sensitivity
敏感性又称真阳性率，就是发病之后，你的诊断方法对疾病的敏感程度（识别能力）。

敏感性越高，漏诊概率越低。

特异性 Specificity
特异性又称真阴性率，不发病（我们这里称之为健康）的特征是有别于发病的特征的，我们利用这些差异避免误诊，那么诊断标准对于这些差异利用的如何就用特异性来表示。

特异性越高，确诊概率越高。
========================

从这个表格中可以引出一些其它的评价指标： 
- ACC：classification accuracy，描述分类器的分类准确率 
计算公式为：ACC=(TP+TN)/(TP+FP+FN+TN) 
- BER：balanced error rate 
计算公式为：BER=1/2*(FPR+FN/(FN+TP)) 
- TPR：true positive rate，描述识别出的所有正例占所有正例的比例 
计算公式为：TPR=TP/ (TP+ FN) 
- FPR：false positive rate，描述将负例识别为正例的情况占所有负例的比例 
计算公式为：FPR= FP / (FP + TN) 
- TNR：true negative rate，描述识别出的负例占所有负例的比例 
计算公式为：TNR= TN / (FP + TN) 
- PPV：Positive predictive value 
计算公式为：PPV=TP / (TP + FP) 
- NPV：Negative predictive value 
计算公式：NPV=TN / (FN + TN) 
其中TPR即为敏感度（sensitivity），TNR即为特异度（specificity）。

2、测试例子 

十次十折后计算的预测标签

计算例子，比如第10次计算，通过excel筛选器，

筛选预测pda=1,label =1,共TP = 53个病例.

筛选预测pda=1,label =0共FP = 4个病例.

筛选预测pda=0,label =1,共FN = 11个病例.

筛选预测pda=0,label =0,共TN = 44个病例.

	金标准（标准集）
预测算法（预测集）		验证存在（T）	验证不存在（F）	合计
	预测存在（P）	预测为正，真实为正（TP=53）	预测为正，真实为负（FP=4）	P=57（预测为正样本）
	预测不存在（N）	预测为负，真实为正（FN=11）	预测为负，真实为负（TN=44）	N=55（预测为负样本）
	合计	T=64（验证为正样本）	F=48（验证为负样本）	所有样本数（P+N或者T+F=112）

 

 敏感性 （sensitivity） TPR = TP / ( TP+FN ) = TP / T  =0.828125

特异性（specificity） TNR= TN / (FP + TN) = 44/48 = 0.9166666666666667

准确率（Accuracy）：Acc = ( TP + TN ) / ( P +N ) = （53+44 ）/112 = 0.8660714285714286

ROC 曲线TPR,FPR计算例子：

1、ROC曲线是如何计算得到的？ - 知乎

2、目标检测Object Detection下的P-R曲线，AP，mAP，AUC，ROC曲线详解_喵喵扫描仪的博客-CSDN博客_目标检测roc曲线

3、P-R曲线及与ROC曲线区别 - 光彩照人 - 博客园

4、ROC曲线、P-R曲线以及mAP_Mr_health的博客-CSDN博客_roc曲线使用场景

5、P-R曲线深入理解_keep_forward的博客-CSDN博客_p-r曲线

6、计算P-R曲线的代码：

sklearn.metrics.precision_recall_curve(y_true, probas_pred, pos_label=None, sample_weight=None)

sklearn.metrics.average_precision_score则计算预测值的平均准确率（AP: average precision）

 python画PR曲线（precision-recall曲线）_Mr.Jcak的博客-CSDN博客_precision_recall_curve

7、用sklearn库自动计算tp,fp,tn,fn,计算acc,sen,spe,f1-score,precision指标。

参考文章：

1）sklearn中混淆矩阵（confusion_matrix函数）的理解与使用_秃头崽崽的博客-CSDN博客_sklearn 混淆矩阵

2）Python sklearn.metrics.confusion_matrix实例讲解 - 码农教程

3）机器学习笔记－－classification_report&精确度/召回率/F1值_阿卡蒂奥的博客-CSDN博客_classification report

具体代码如下：

# aip指标
    fpr_aip, tpr_aip, thresholds = metrics.roc_curve(roc_aip_gt_labels, roc_aip_pre_scores, drop_intermediate=False)
    auc = metrics.auc(fpr_aip, tpr_aip)
    all_indicators_aip["auc"].append(auc)

    y_pred = np.where(np.array(roc_aip_pre_scores) > 0.5, 1, 0)
    tn, fp, fn, tp = metrics.confusion_matrix(roc_aip_gt_labels, y_pred, labels=[0, 1]).ravel()
    print(metrics.classification_report(roc_aip_gt_labels, y_pred, target_names=['BG', 'AIP'],
                                        digits=4))  # target_names和上面的labels对上
    sen = tp / (tp + fn)
    all_indicators_aip["sen"].append(sen)
    spe = tn / (tn + fp)
    all_indicators_aip["spe"].append(spe)
    precision = tp / (tp + fp)
    all_indicators_aip["precision"].append(precision)
    acc = (tp + tn) / (tp + fp + tn + fn)
    all_indicators_aip["acc"].append(acc)
    f1_score = 2 * precision * sen / (precision + sen)
    all_indicators_aip["f1_score"].append(f1_score)