人全外显子组测序WES学习笔记 第一天

本文介绍了全外显子组测序(WES)的基础知识,包括外显子、外显子组、全外显子测序的定义与优势,以及高通量测序和相关文件格式FASTA与FASTQ。WES是利用序列捕获技术对全基因组外显子区域进行测序,常用于研究SNP和INDEL等遗传变异。
摘要由CSDN通过智能技术生成

人全外显子组测序WES学习笔记

一.基础知识

1.名词释义

外显子: 外显子 (expressed region) 是真核生物基因的一部分,它在剪接 (Splicing) 后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟 RNA 中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的 RNA 分子中的核苷酸序列。在人类基因中大约有 180,000 外显子,占人类基因组的 1%,约 30 MB。
外显子组:基因组中的全部外显子称为外显子组。
全外显子测序:全外显子测序 (Whole Exome Sequencing, WES),也称目标外显子组捕获,是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域 DNA 捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。是一种选择基因组的编码序列的高效策略,外显子测序相对于基因组重测序成本较低,对研究已知基因的 SNP、INDEL 等具有较大的优势。WES是一种基于NGS测序平台的一种检测方案。
高通量测序:高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)&
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