今天继续分享单细胞蛋白组学数据网站,之前的网站SPDB分享不够全面,这几天查阅文献发现了一个宝藏单细胞蛋白质组学数据知识库—SingPro。
该知识库涵盖了基于流式技术和基于质谱技术的数据,目前有R包已经记录了部分单细胞蛋白组学数据,如scpdata,但是该包没有提供相应的原始数据,也缺少清楚的单细胞分选与制备方法、质谱数据采集方法以及单细胞组学数据分析方法等。为了让大家更快更清楚的认识和上手进行数据分析,SingPro收集了近几年前沿的文章,大家可以对感兴趣的研究领域进行文献阅读与数据分析复现。
网站界面:
重要的事情说一遍:不需要登录注册,直接点击使用,特别良心的网站。
主要分为两个板块,一个是基于质谱技术的,另一个是基于流式技术的。
MS-based SCP界面:
可以根据组织/器官、细胞类型、实验方法、定量策略等进行筛选,可以筛选出感兴趣的文章以及对应的研究结果。
FC-based SCP界面:
文章筛选界面:
点击project detail查看更多关于文章的细节,包括研究目的、研究对象、样本类型、发表情况、详细的实验方法等。
最重要的一点是它提供文章结果下载,包括原始数据、中间文件等。
唯一不足的就是没有提供数据分析路径的下载,这个要自行到文章中查看。
好了,有这个网站,相信大家不需要做单细胞相关实验也可以进行数据挖掘了,你可以进行分析方法优化、数据分析学习、算法优化等。
如果你对单细胞蛋白质组学数据分析也感兴趣的话,请联系我,大家一起交流学习更多技术,如有疑问,也请联系管理员:kriswcyYQ!!!