Question 1:什么是ANOSIM分析?
ANOSIM分析(Analysis of Similarities)即相似性分析,主要用于分析高维数据组间相似性,为数据间差异显著性评价提供依据。在一些高维数据分析中,需要使用PCA、PCoA、NMDS等方法进行降维,但这些方法并不显示组间差异的显著性指标,因此可以使用ANOSIM分析解决此问题。
ANOSIM相似性分析是一种非参数检验,用来检验组间(两组或多组)差异是否显著大于组内差异,从而判断分组是否有意义。首先利用Bray-Curtis算法计算两两样品间的距离,然后将所有距离从小到大进行排序,并计算R和P值。R值用于不同组间属否存在差异,P值用于说明是否存在显著差异。
Q2:如何应用ANOSIM?
ANOSIM was used to compare within- and between-group similarity through a distance measure, to test the null hypothesis that the average rank similarity between samples within a group is the same as the average rank similarity between samples belonging to different groups.
参考文献:
Effect of Different Hemodialysis Methods on Microbiota in Uremic P