illumina测序原理

一些常用基本概念的介绍：

flowcell流动池

是指Illumina测序时，测序反应发生的位置，1个flowcell含有8条lane

lane通道

每一个flowcell上都有8条泳道，用于测序反应，可以添加试剂，洗脱等等

tile

每一次测序荧光扫描的最小单位

reads

指测序的结果，1条序列一般称为1条reads

bp

base pair碱基对，用于衡量序列长度

双端测序

指一条序列可能比较长如500bp，我们可以两端每端各测150bp

junction

上面说的双端测序，中间会留有200bp测不到的东西，我们叫junction

adapter

就是测序中需要的一段特定的序列，有类似于引物的功能

primer

PCR中的引物

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