生信基因序列比对相关软件安装fastqc、hisat2、bwa、samtools；GATK docker安装

本文章ubuntu环境下安装:
流程：
fastq格式处理==》sam格式比对结果==》bam格式（二进制sam）

1、fastqc 基因测序reads质量检测

sudo apt-get install fastqc

##或conda形式安装：
conda install -c bioconda fastqc

查看安装：
fastqc --version

2、hisat2 序列比对

sudo apt-get install hisat2

查看安装：
hisat2 --version

其他比对软件bowtie2、bwa

sudo apt-get install bo