lncRNASNP:SNP位点对lncNA结构和lncRNA-miRNA影响的数据库

lncRNASNP是一个综合资源库,汇集了人类和小鼠lncRNA上的SNP信息,探讨SNP如何影响lncRNA结构及lncRNA-miRNA相互作用。数据库提供lncRNA基本信息、SNP位点、相关疾病、结合位点信息以及TCGA表达谱,并提供在线工具分析突变影响。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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lncRNASNP数据库收集整理了人和小鼠中位于lncRNA基因上的SNP位点信息,通过以下两种思路将lncRNA与SNP结合起来

  1. 探究SNP位点对于lncRNA结构的影响

  2. 分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响

除此之外,还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息,比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱,SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库的网址如下

http://bioinfo.life.hust.edu.cn/lncRNASNP2

对于一个lncRNA, 包含了以下几种信息

1. 基本信息

2.  位于lncRNA上的SNP位点

包含以下3种来源的SNP位点

  1. dbsnp

  2. TCGA

  3. Cosmic

dbsnp数据库为例,结果示意如下

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