aspera上传数据至NCBI

aspera安装与使用（NCBI上传下载工具）-生物信息学工具31

要使用Aspera命令行上传文件并完成提交，您可以按照以下步骤操作：

第一步：准备您的文件

1. 组织文件：确保每个提交的序列文件都在一个目录中，不要在目录中创建复杂的子目录结构。
2. 创建新目录：为每次提交创建一个新的目录。这个目录是临时的，会在提交处理完毕后被删除。
3. 命名规范：文件和文件夹名称应使用ASCII纯文本字符，尽量只使用大写或小写字母（A-Z）、数字（0-9）、连字符（-）和下划线（_）。确保单个文件小于100 GB。

第二步：安装Aspera Connect软件

1. 下载并安装：Aspera Connect 软件。

第三步：获取密钥文件

1. 下载密钥文件：密钥文件是上传的关键，确保保密，不要将其分享或公开发布。

第四步：使用Aspera命令行上传文件

1. 打开命令行终端。

2. 使用以下命令上传文件：

ascp -i <path/to/key_file> -QT -l100m -k1 -d <path/to/folder/containing files> subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/xingyuanyuan01_126.com_5zAHTWNu
###其中：
<path/to/key_file>：为密钥文件的绝对路径，例如：/home/keys/aspera.openssh
<path/to/folder/containing files>：为包含所有要上传文件的本地文件夹路径。

第五步：完成提交

1. 上传完成后，返回提交页面并选择已上传的文件夹。
2. 提交时间：请在创建文件夹后的30天内完成提交。如果在30天内没有完成提交，这些文件将被自动删除。

注意事项

• 如果上传的数据量超过5 TB，请先与对方联系。
• 建议新提交者先尝试小量数据的提交，以熟悉流程。
• 文件上传后需要至少等待10分钟才能在提交页面中选择。
• 如果将文件上传到帐户级目录，将无法用于提交，且会在30天不活动后被删除。

示例

假设您的密钥文件在/home/user/keys/aspera.openssh，文件夹路径为/home/user/data/，您可以使用以下命令上传：

ascp -i /home/user/keys/aspera.openssh -QT -l100m -k1 -d /home/user/data/ subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/xingyuanyuan01_126.com_5zAHTWNu

上传完成后，返回提交页面选择文件夹并完成提交。