一区！孟德尔随机化＋四个数据库＋可成药基因发高分SCI| 孟德尔随机化周报（11.24-11.30）...

孟德尔随机化，Mendelian Randomization，简写为MR，是一种在流行病学领域应用广泛的一 种实验设计方法，利用公开数据库就能轻装上阵写文章，甚至是高质量的论文。

通过PubMed数据库“ Mendelian randomization”检索发现，11.24-11.30共发表71篇相关主题论文，其中共6篇医学1区，17篇医学2区文章，部分文章介绍如下。

中国学者：

1.中国学者文章介绍（一）

文章题目：揭示乳腺癌中的免疫细胞相关基因：基于基于汇总数据的孟德尔随机分析和共定位研究

研究目的：观乳腺癌是全球女性中最普遍的癌症形式，包括需要不同治疗方法的各种亚型。肿瘤微环境和免疫反应在乳腺癌的发生发展中具有至关重要的意义。然而，关于乳腺癌内基因 - 特异性免疫细胞的证据很少。

研究方法：我们利用基于汇总数据的孟德尔随机化 （SMR） 来识别与乳腺癌相关的基因，方法是利用 14 种不同免疫细胞类型的表达数量性状位点 （eQTL） 数据集和整体乳腺癌及其亚型的全基因组关联研究 （GWAS）。此外，进行了共定位分析以评估在 SMR 分析中观察到的关联是否受相同因果变异的影响。采用复制分析和批量 RNA 测序 （bulkRNA-seq） 分析来验证有前景的免疫基因作为潜在的药物靶点。

研究结果：在校正错误发现率后，我们发现 9 种免疫细胞类型中共有 17 个基因与整体乳腺癌及其亚型显著相关。基因 KCNN4 、 L3MBTL3 、 ZBTB38 、 MDM4 和 TNFSF10 在整个乳腺癌及其亚型中被鉴定出来。共定位分析为支持这些关联提供了强有力的证据。值得注意的是，非经典 MONOcytes （MONOnc） 中的 KCNN4 基因通过复制分析和 bulkRNA-seq 分析进一步验证。

结论：总之，我们的研究揭示了与乳腺癌相关的不同免疫细胞中的一系列基因。非经典单核细胞 （MONOnc） 中的 KCNN4 基因与整体乳腺癌及其亚型呈负相关，这被确定为乳腺癌的潜在药物靶点，为治疗干预开辟了新的途径。

2.中国学者文章介绍（二）

文章题目：鉴定介导吸烟与原发性高血压之间因果关系的新型蛋白质：一项孟德尔随机化研究

研究目的：吸烟是高血压的一个因素。我们旨在揭示介导吸烟与高血压关系的新型血浆蛋白，并在孟德尔随机化设计的基础上确定高血压的潜在药物靶点。

研究方法：吸烟数据选自全基因组关联研究和酒精和尼古丁使用测序联盟进行的最大规模的全基因组关联研究荟萃分析。血浆蛋白的数据选自 deCODE Health 研究和英国生物样本库制药蛋白质组学项目。高血压数据提取自 FinnGen 研究。此外，还进行了蛋白质组范围的孟德尔随机化和共定位分析、2 步孟德尔随机化、基因功能和网络预测以及成药性评估。

研究结果：我们最终确定了 8 种蛋白 （ANXA4 [膜联蛋白 A4]、DLK1 [蛋白 δ 同源物 1]、KLB [β-klotho]、MMP8 [基质金属肽酶 8]、PLAT [组织型纤溶酶原激活剂]、POSTN [骨膜蛋白]、SAT2 [噻赖氨酸 N-ε-乙酰转移酶] 和 IFNLR1 [干扰素 λ 受体 1]）介导吸烟与高血压的关系。PLAT 和 IFNLR1 被鉴定参与补体和凝血级联反应以及 Janus 激酶/信号转导和转录信号激活因子通路。ANXA4 、 KLB 、 MMP8 、 PLAT 和 IFNLR1 具有成药性。此外，IFNLR1 具有遗传共定位的有力证据，因为 IFNLR1 的 H4 后验概率为 91.3%。

结论： 本研究确定了介导吸烟与原发性高血压之间因果关系的 8 种蛋白质。靶向 IFNLR1 的干扰素 λ 受体激动剂可能为治疗高血压开辟一条新途径。我们的发现为高血压的蛋白质发病机制提供了新的见解，并更好地指导吸烟者高血压的预防和治疗。

3.中国学者文章介绍（三）

文章题目：多囊卵巢综合征和乳腺癌的共同遗传景观：ER + 乳腺癌收敛，而不是 ER- 乳腺癌

研究目的：反多囊卵巢综合征 （PCOS） 和乳腺癌 （BC） 之间的临床高合并症已被广泛报道。然而，关于它们共同的遗传基础和潜在机制的知识有限。

研究方法：利用迄今为止最大的全基因组关联研究 （GWAS） 的汇总统计数据，我们对 PCOS 和 BC 进行了全面的全基因组交叉性状分析。采用了多种遗传统计方法来揭示潜在的共同遗传原因。

研究结果 : 我们的分析揭示了三个性状对之间的遗传重叠。将基因组划分为 2,495 个独立区域后，我们确定了两个位点，chr8：75,011,700-76,295,483 和 chr17：6,305,079-7,264,458，具有显着的局部遗传相关性。在复合零假设下的多效性分析确定了三个性状对中的 1,183 个显著的多效性单核苷酸多态性 （SNP）。FUMA 绘制了 26 个多效性基因座，其中 16q12.2 和 6q25.1 区域在所有三个性状对中重复，而 COLOC 检测到三个具有共定位证据的基因座。基于基因的分析确定了 23 个独特的候选多效性基因，包括所有性状对共享的 FTO，以及两个性状对中的 SER1 、 RALB 和其他基因。通路富集分析进一步突出了关键的生物通路，主要涉及重要的生物通路是调节自噬的代谢、细胞分解代谢过程的调节和分解代谢过程的正调控。潜在遗传性混杂因素孟德尔随机化 （LHC-MR） 支持 PCOS 与 BCALL 和 ERPBC 之间的正因果关系，但与 ERNBC 无关。