叶绿体边界区域可视化对比~irscope本地化、使用（图文教程）

前言

大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构，即由LSC、SSC以及一对IR区域构成，IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比，从而对该科/属的叶绿体的结构有一个更加宏观的认知。

一、获取工具

irscope是一个在线工具，网址为：https://irscope.shinyapps.io/irapp/

但是在线工具很不稳定，会经常会出现进网站很慢，或者运行时总是出错的情况，比如这样

可以参照这个教程将irscope本地化后使用

视频教程：IRscope的本地化使用方法~叶绿体基因组边界收缩扩张结果展示_哔哩哔哩_bilibili

二、利用R语言将irscope本地化

可能由于网站更新等缘故，本地化过程稍有不同

   首先进入网站：