前言
NJ法(Neighbor-Joining Algorithm,邻接法)和ML法(Maximum likelihood,最大似然法)都是构建系统发育树常用的方法。
一、MEGA建立系统发育树——NJ法
MEGA是一个功能非常强大的分子进化遗传分析软件,可用于序列比对、进化树的推断、估计分子进化速度、验证进化假说等。这是一款免费的软件,官网下载地址为:HomeMEGA is an integrated tool for conducting automatic and manual sequence alignment, inferring phylogenetic trees, mining web-based databases, estimating rates of molecular evolution, and testing evolutionary hypotheses.