Nature Methods | 空间转录组与单细胞转录组整合分析工具性能测试

Hello，我还是那个👉 时不时分享、汇总、比较空转工具的小编~今天给大家“投喂”的这篇文献来自Nature子刊《Nature Methods》，研究人员对空间转录组和单细胞转录组整合分析工具进行比较，以衡量其性能。

空转&scRNA-seq整合分析工具性能测试

空间转录组学方法允许我们在空间中检测RNA转录物，这些方法已被用于研究各种组织和器官中基因表达的空间分布，包括大脑、心脏、胰腺和皮肤。一方面，基于原位杂交和荧光显微镜（基于图像）的空间转录组学方法（包括seqFISH、osmFISH和MERFISH）能够以高分辨率和准确度检测转录物的空间分布，但它们只能检测RNA转录物的总数。另一方面，基于下一代测序（基于测序）的空间转录组学方法，如ST、10X Visium和Slide-seq，可以从空间中的点在整个转录组水平上捕获表达的RNA，但每个点（半径10~100µm）可能包含多个细胞，这限制了这些方法的空间分辨率。这些空