R中使用topGO进行富集分析

已知文件如下

• DEG.list #差异基因list
• rice.map #物种注释到GO数据库的信息 一般只用到上面两个文件就可以
• rice.map # 1. blast2go 软件做注释，再使用 mapping2maplist.pl 脚本进行格式转换 # 2. 可以直接从数据库下载，再使用 plaza2maolist.pl 脚本进行格式转化

原始数据上传到百度网盘：
链接：https://pan.baidu.com/s/1QVd-s9PWY9f0LpMCQcsyFw
提取码：51og
###下面放出完整操作R代码，只需要修改导入的文件就可直接运行得到结果

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#####  2020/3/6 w
#####  topGO
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# 安装topGO软件包
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("topGO", version = "3.8")
BiocManager::install("Rgraphviz", version = "3.8")

# 设置工作目录，后面读取文件什么的就可以直接读取不需要那么长的路径
setwd('D:/test_data')

# 加载包
rm(li