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nanopore是非常适合实验室单独运行的测序设备,无需投入大量资本。而不像二代测序,需要昂贵的购买测序仪成本以及运行成本。也许在不久的将来,测序仪将如PCR仪一样普通”飞入寻常百姓家“。这次内容我们将给大家介绍一下最新的nanopore测序相关产品。
注:本次内容全部来自nanopore官网产品近期介绍,经常会更新,更多内容大家可以自行去nanopore官方查看,或者联系他们公司人员,本次内容无广告赞助(哈哈哈)。
产品介绍:https://nanoporetech.com/cn/products
查看价格:https://nanopore.yilimart.com/
如何计算数据产出量
数据产出量是测序仪一个重要指标,nanopore的主要产品也是根据数据产出来进行区分。选择适合自己一个重要原则也是需要根据自己数据分析所需数据量。例如分析人基因组,单次数据产出至少要30G,那么数据产出太少的的测序仪产品不合适。如果只做细菌,那么产出数据太多的产品也比较浪费。每款测序仪产品官方都会给出目前最大数据产出量。如果觉得记忆比较麻烦,其实这里也有一种比较简单的计算方法,就是根据纳米孔数多少来计算。目前纳米孔每秒流过碱基数目是400bp左右,那么如果是512个纳米孔,每秒测序量就是200K左右,那么一分钟产出数据约12.3M,同理,我们就可以计算出一小时数据量为738M,48小时则为35G。这些都是理论计算值