转录组分析数据准备

转录组分析数据准备

在这之前，我们要明白，进行转录组分析，我们需要那些文件

1. 测序数据
2. 样本信息表
3. 基因组序列(genome.fasta)
4. 基因注释文件(genes.gtf)
5. 蛋白序列（proteins.fasta）
   其中，测序数据可以自己去公司测序，或在公开的资源网站进行下载。
   样本信息表，是自己根据测序数据进行编辑。至于基因组序列，基因注释文件和蛋白序列文件，则需要自己在网上下载，今天我们就介绍怎么样从ensembl上面下载这三组数据，选择ensembl的是因为它更新快，而且数据可靠。

数据的下载

首先，我们打开浏览器输入ensembl，进入它的官网

可以在search栏里面查找自己感兴趣的物种，或者直接点击用的比较多的人，小鼠或者斑马鱼的数据，我们就以人为例，来进行下载

基因组序列文件

我们先点击Genome assembly: GRCh38.p13下面的dowload sequence（