使用GDC API查询与下载数据

最新推荐文章于 2022-11-06 10:01:05 发布

Oliver-nana

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分类专栏： python与生信文章标签： json

本文链接：https://blog.csdn.net/zhangyingna667/article/details/105354379

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本文介绍了如何使用GDC API进行数据查询和下载，通过详细的命令展示，揭示了在实际操作中的步骤和效果。

摘要由CSDN通过智能技术生成

#以UUID为d853e541-f16a-4345-9f00-88e03c2dc0bc为例
#01使用GDC API查询数据
#教程网址：https://docs.gdc.cancer.gov/API/Users_Guide/Search_and_Retrieval/
#1.1等效链接：https://api.gdc.cancer.gov/files/d853e541-f16a-4345-9f00-88e03c2dc0bc?pretty=true
#1.2等效命令：curl -X GET https://api.gdc.cancer.gov/files/d853e541-f16a-4345-9f00-88e03c2dc0bc?pretty=true

#1.3实现代码
import requests
import json

file_endpt = 'https://api.gdc.cancer.gov/files/'
file_uuid = 'd853e541-f16a-4345-9f00-88e03c2dc0bc?pretty=true'
re