用殷赋科技的小工具预测结合口袋（短）

程序链接：

https://cloud.yinfotek.com/

操作得到活性口袋坐标pdb文件：

打开链接，在【首页】的左侧，有①【小工具】的选择。

选择②【分子结构】下的③【识别结合位点】

 在打开的【识别结合位点】界面里：

 在界面内①上传本地受体pdb，在②可以可视化pdb受体结构。

点击①下方的【检查位点】

 点①选择检查到的最大口袋，点击②让口袋在可视化界面出现，点击③下载这个口袋的pdb文件的zip包。

根据文献提到的位点附近出现的受体残基信息，我们在VMD里显示：

①口袋：口袋是一个用H原子组成的不规矩体，（在pdb里只有H原子，用VDW模式打开）

②关键残基：文献里提到的残基用colorID显示。

 我们定位出较好的配体放置位置。移动配体到合适位置，保存为新的pdb，再进行对接预测。