Hic-Pro的安装

对于一个生信小白Hic-Pro的安装真的是有点困难的了，我是在不了解Linux、python...下安装的，下面就记录一下我安装Hic-pro的心路历程。

HiC-Pro是目前比较流行的HiC数据标准化处理工具之一，其流程主要分为6个步骤，比对、过滤HiC比对结果、检测有效HiC序列、结果合并、构建HiC关联图谱以及关联图谱标准化。

首先看一下Github的介绍

 Hic-pro已经用的是python3（>3.7）了，现在很多帖子是很多年前的还是用的python2，这个要注意一下。

安装hic-pro的依赖包：bowtie2、python的四个库pysam（>=0.15.4）、bx-python(>=0.8.8)、numpy(>=1.18.1)、scipy(>=1.4.1),安装R的两个包RColorBrewer和ggplot2(>2.2.1)、g++、samtools(>1.9)

先安装conda

清华大学开源软件镜像站https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/