生信技能45 - 基于docker容器运行生信软件

生信与基因组学

已于 2024-05-07 16:32:31 修改

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分类专栏：生信分析项目实战技能合集文章标签： docker 容器数据挖掘数据分析 linux

于 2024-05-07 11:09:17 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/LittleComputerRobot/article/details/138522537

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本文详细介绍了如何利用Docker容器运行生信软件，包括获取docker镜像、理解docker目录结构、进行基本操作、后台启动容器、挂载目录、进入容器内部、添加执行权限、执行内部脚本、删除容器以及启动Web容器等步骤，以xhmm CNV分析软件和Flask框架的应用为例。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

1. 获取docker镜像

以运行xhmm CNV分析软件为例。

# 搜索仓库镜像
sudo docker search xhmm

# 拉取镜像
sudo docker pull ksarathbabu/xhmm_v1.0

# 启动镜像,非后台
sudo docker run -it ksarathbabu/xhmm_v1.0 /bin/bash
# -i: 交互式操作。
# -t: 终端。
# ksarathbabu/xhmm_v1.0: ksarathbabu/xhmm_v1.0镜像。