miRNA-转录组-蛋白组联合分析
microRNA(miRNA)是一类长度约20-24nt的具有调控功能的非编码 RNA,在生物体内,miRNA主要通过与靶基因 mRNA结合,调控靶 mRNA 的翻译,最终抑制基因的表达。蛋白质是生物体最终的功能执行着,其含量随着生物体的生长、环境应激反应、疾病发生发展的过程不断变化。而蛋白质作为 mRNA 的翻译产物,其表达量也会受到miRNA的表达调控。
通过研究miRNA-mRNA-蛋白质之间的相互作用关系,可以系统的研究miRNA与mRNA之间的相互调控关系,miRNA与蛋白之间的调控关系以及miRNA-mRNA-蛋白质三者之间的相互作用关系,从而更加系统的研究生物体内基因表达的调控机制。为疾病的发生发展,以及基础科学研究提供新的思路。
主要分析内容
- 通过miRNA靶基因数据库,进行miRNA与靶基因互作分析。
- 通过基因与蛋白之间的关系,进行mRNA与蛋白关联分析。
- 分别对筛选出来的基因进行关联分析,KEGG通路富集分析,GO 富集分析,互作网络分析。
- mRNA, mRNA与蛋白关联分析。
- 关联数据表达模式聚类分析。
- 关联数据网络图。
- 蛋白互作网络图。
通过miRNA-mRNA-蛋白质之间的相互作用关系,可以找到一些关键靶点,作为生物标志物的研究对象。