功能富集分析 | GO| KEGG

写在前面

我们《复现SCI文章系列教程》专栏现在是免费开放，推出这个专栏差不多半年的时间，但是由于个人的精力和时间有限，只更新了一部分。后续的更新太慢了。因此，最终考虑后还是免费开放吧，反正不是什么那么神秘的东西。原本就是一个套路的文章，此外，这篇文章也相对比较简单。在此章节以前，还有一个WGCNA的分析，你若需要可以看**WGCNA分析 | 全流程分析代码**

目前全部开放链接：

1. SCI文章复现 | GEO文章套路，数据下载和批次效应处理
2. 差异分析和PPI网路图绘制教程

原付费：复现SCI文章系列教程文章

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2. 复现SCI文章系列 | 第一篇文章复现：1. 文章讨论与文章分析套路讲解
3. 2.1 材料与方法 (IF 7.3)
4. 2.2 数据集下载 (IF 7.3)
5. 2.3 数据去重和标准化(附送去批次效应)
6. 2.4 差异分析
7. 2.5 加权基因共表达分析(WGCNA)
8. 2.6 PPI网络分析

本期推文内容

2.7.1 章节总结

在前的教程中，我们已经获得差异基因(2.4 差异分析)和获得与纤维化相关的模块基因。此教程，我们做功能富集分析。但是，此数据问题依旧是很大的影响因素，严重影响后续的分析。

2.7.2 文章结果内容

1. GO和KEGG富集分析结果
   
2. 分析结果图
   

2.7.3 取交集

根据文章分析流程，将DEGs和WGNCA分析获得的结果去交集，获得的交集基因进行后续分析。

在差异分析中，我们获得600多个DEGs，在WGCNA分析中，与纤维化相关的模块为“yellow”。

共有200多个基因。