rDock安装方法

1.简易安装

此方法满足常规对接需求。

conda install -c bioconda rdock

2.常规安装

这种方法不适用Ubuntu18.04（不懂什么原因，在好几台设备上都无法成功）, 但在Ubuntu16.04可以正常安装。Ubuntu20.04没有尝试。

2.1 安装依赖关系

sudo apt install gcc g++
sudo apt install libpopt-dev libpopt0
sudo apt install libcppunit-dev libcppunit-doc
sudo apt install make

2.2 安装rdock

关注grosetta公众号，后台回复‘rdock’获取安装包

tar -zvxf rDock_2013.1_src.tar.gz  #解压
cd rDock_2013.1_src/build

# 如果是32位系统，则
sudo make linux-g++

# 如果是64位系统，则
sudo make linux-g++-64

2.3 验证安装

sudo make test

如上图所示，执行了55个测试都成功了，但最后还是给了个error。又查看了bin文件夹,发现可执行文件成功生成。后续使用过程发现没有什么问题，因此此报错可以忽略

2.4 配置环境变量

将下面的内容添加至~/.bashrc中。

export RBT_ROOT=/path/to/rDock/installation/
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$RBT_ROOT/lib
export PATH=$PATH:$RBT_ROOT/bin