结构预测、功能注释、分子对接 —— 这个网站全包了

今天向大家介绍一个集合了蛋白结构预测、功能注释、cadd等相关功能的在线服务网站：
https://zhanggroup.org/

如下图，左边栏列出了它的所有功能。挑了几个使用频率可能比较高的几个仔细了解了一下。

I-TASSER

I-TASSER是一种蛋白质结构预测和基于结构的功能注释的分层方法。它首先使用LOMETS找寻建模的模板pdb结构，然后经过多次碎片组装模拟最终建立起目标序列的三维结构。这之后将该预测出的三维结构放到他们自己构建的结构功能注释数据库（BioLiP）进行功能注释。
*注意：还网页的所有在线工具均需要注册（限学术邮箱）

C-I-TASSER

C-I-TASSER是一种从I-TASSE发展而来的高精度结构预测与功能注释的工具。它首先使用深度学习神经网络训练的contact map预测模型获得你所提交序列的contact map。然后使用LOMETS找寻建模的模板pdb结构，最后用contact-map指导的副本交换蒙特卡洛模拟对模板pdb碎片组装以获得最终的预测结果。将预测的结构上传至功能注释数据库ÿ