ChIP-Seq相信很多老师已经很熟悉了,然而在做ChIP-Seq实验时,甲醛交联的效果,抗体的选择,超声的效果等因素都很大地影响了实验的成功率,您是否也在为此苦恼呢?下面派森诺生物就带大家了解一下ChIP-Seq的“升级版”- CUT&Tag,相较于传统的ChIP-Seq, CUT&Tag将繁复的ChIP-Seq变成更为便捷简单的操作,为研究DNA-蛋白质相互作用提供了更为有效的工具。
1.CUT&Tag 是什么?
CUT&Tag 是蛋白质-DNA 互作关系研究的新方法,能在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA片段,是新一代超微量ChIP-Seq技术,适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互作的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有重要的意义。
2.CUT&Tag的流程?
① 收集细胞;
②分别孵育一抗和二抗;
③孵育pA/pG-Tn5转座子(HyperactivepA/pG-Tn5 Transposon);
④激活转座子,进行DNA片段化;
⑤DNA提取;
⑥文库扩增与纯化。
3.CUT&Tag 技术的基本原理?
在抗体引导下,ChiTag 酶仅在目的组蛋白修饰标志、或转录因子、或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的 DNA 的片段化的同时添加测序接头