单细胞测序探索小鼠胚胎时期脑组织的发育

哺乳动物大脑是在多种复杂因素相互作用下发展起来的，包括形态发生、细胞间相互作用和内在的遗传程序，最终形成一千多种不同的细胞类型。单细胞转录组和空间转录组揭示复杂组织分子异质性的能力，特别适合在大脑发育的整个时空范围内对细胞状态进行系统地研究。本文提供了小鼠胚胎从原肠胚形成到分娩之间大脑发育的完整单细胞转录组图谱。确定了近800种细胞类型，这些细胞类型描述了大脑及其封闭膜的功能元件的发育过程。并且结合原位杂交技术绘制了关键发育基因的空间表达图谱，揭示了神经系统发育过程中神经祖细胞的准确空间位置。

材料方法

选择了小鼠胚胎第7至第18天（E7-E18）不同部位，共93个样品进行单细胞测序，经过分析保留了292,495个细胞。每个细胞平均检测到 5,766 个UMI和 1,934 个基因。

研究结果

经过分析，共得到了798个细胞类，作者根据脑细胞的主要类别（例如，成纤维细胞、血管、免疫、放