overlap的显著性检验-超几何检验/Fisher`s 检验

1. 回顾超几何分布的定义

一般地，假设共有N件产品，其中M件次品，现在从中抽取n件做检查，抽到k件次品的概率分布服从超几何分布。

数学表达式如下：

2. 超几何分布的一个应用：求解overlap显著性

• 以一个实际的生物实验为例。
  
  在上述实验中，我们假设总共的基因个数为20000个（假定为产品的总数），图中左边圈的总数为2005（1740+265）个（假定为次品的总个数），现从中抽取805（540+265）个，需要计算得到基因的个数（次品数量）大于等于265的概率。

思考过程：在次品个数是少数的情况下，overlap越高，从超几何分布来看，发生的概率越小。现在的overlap是265，可能会是过高的那种情况，那么现在计算overlap是265以及大于265的概率之和，如果这个概率很小，那就说明发生265这个事件不是随机的&#