metascape 功能注释工具
1.网址
https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1
metascape是一个在线的功能注释网址,使用简单,说明详细,一般转录组测序分析中,挑选出的差异基因可以使用这个网址进行功能注释。
2.输入
推荐使用文档或EXCEL文件,内容包含基因的信息,可以是gene ID 或者 symbol。
3.选择物种
选择本次研究的基因对应的物种。
4.执行
在默认的设置下可以点击Express Analysis一键执行,个性化设置点击Custom Analysis。
5.结果下载
点击 Analysis Report page,然后 下载 Zip file,按照说明文档查看结果。
6. 个性化设置
ID conversion 可以进行数据的筛选
Annotation 选择描述,需要注释的数据库相关信息,然后点击apply
membership,选择搜索范围,输入感兴趣的内容,比如cancer等,然后点击apply
Enrichment , pathway和PPI富集分析,选择感兴趣的数据库,设置参数,点击 Enrichment Analysis, 完成后点击apply,之后可以在analysis report page 查看或者下载分析结果