利用VARNA来画tRNA的二级结构

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已于 2022-03-04 21:39:50 修改

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分类专栏：生物信息 Python 文章标签：生物学生物信息学 python

于 2022-03-04 21:23:01 首次发布

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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_50637636/article/details/123285528

版权

本文介绍了转运RNA（tRNA）的结构与功能，并详细讲解了如何下载安装VARNA，一个用于绘制tRNA二级结构的Java程序。内容包括Java环境的设置，解决VARNA安装时的报错问题，以及软件的运行方法。用户可以借助此指南使用VARNA配合tRNAscan-SE或ARWEN进行tRNA结构预测。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

1 tRNA的结构与功能

转运RNA（Transfer RNA），简称为tRNA，是由70~90个核苷酸组成的单链，tRNA的一级结构就是核苷酸的排列顺序，通过折叠形成二级结构，三叶草状。它是在细胞核中一小部分DNA上合成的，罗伯特·W·霍利在1965年提出了tRNA的三叶草模型，三叶草有三个褶皱，四个臂，即反密码子臂（anticodon arm），D臂（d arm），TΨC臂（tc arm）和氨基酸受体臂（amino acid acceptor arm）。除了这四个臂，还有一个可变臂（variable arm），呈弓形。

tRNA的二级结构

2 软件简介

VARNA是一个绘制tRNA二级结构的java程序。官方网址如下：http://varna.lri.fr/。

在这里插入图片描述

3 下载安装

3.1 Java环境的下载安装

进入官网后，点击左上方的Downloads，如果电脑还没有安装java的话，可以点击当前页面的

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