【bioinfo】DNBSEQ测序原理/Barcode/index hopping

DNBSEQ测序

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图来源1

测序原理

DNBSEQ测序技术是一种基于DNA纳米球(DNA Nanoball, DNB)的高通量测序技术。DNBSEQ测序原理主要包括以下几个关键步骤:2

  1. DNA样本制备

首先,从生物样本中提取DNA,并进行片段化处理,将长链DNA切割成较短的片段。这些片段通常在200-500个碱基对之间。

  1. 连接接头

在片段化的DNA两端连接上特定的接头(adapter)。这些接头包含特定的序列,用于后续的扩增和测序。

  1. 滚环扩增(Rolling Circle Amplification, RCA)

通过滚环扩增技术,将单个DNA片段扩增成大量的拷贝,形成一个DNA纳米球(DNB)。每个DNB包含数千个相同的DNA片段拷贝,这些拷贝紧密排列在一起,形成一个球状结构。

  1. DNB阵列制备

将扩增后的DNB固定在测序芯片上,形成一个二维

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