Ensembl数据库下载参考基因组（植物拟南芥）

最新推荐文章于 2024-08-17 21:10:43 发布
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Ensembl数据库下载参考基因组

下面以植物拟南芥为例：

1.进入网站：http://plants.ensembl.org/index.html

attachments-2018-04-EZWUTAGl5adc31bf19049.jpg

一些常用的物种列在首页 拟南芥，水稻，玉米等 如果想要得物种不在首页可以点击：View full list of all Ensembl Plants species ；可以得到所有物种的列表；

attachments-2018-04-yctSTZ0X5adc31cd0bd62.jpg

2. 点击进入拟南芥参考基因组介绍页面；

可以看到拟南芥基因组的介绍信息：

attachments-2018-04-tojMBPyk5adc31dbdb7e9.jpg

3.下载参考基因组：点击Download DNA sequence (FASTA)

attachments-2018-04-3j5J3i7V5adc31edbfec6.jpg

一般我们下载*toplevel.fa.gz文件，为参考基因组完整文件，其他rm，sm，和分开染色体得文件；sm和rm的意义可看README文件

 

 

wangchuang2017
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这个教程也是前面《转录组上游分析》系列教程的中内容，我们今天单独的给作为一个章节来推送出来，因为，并不是所有人都是有这个系列教程有需求，可能你只是对某一个章节的内容感兴趣呢？
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