拟南芥参考基因组

拟南芥参考基因组,使我们进行同源注释,基因家族扩张收缩分析,全基因组复制分析等必备输入文件,目前参考基因组有两个版本:

TAIR10_protein_lists和Araport11_protein_lists

阿拉伯芥信息资源 (TAIR) 维护着一个关于模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)的遗传学和分子生物学数据的数据库。TAIR 提供的数据包括完整的基因组序列、基因结构、基因产物信息、基因表达、DNA 和种子库、基因组图谱、遗传和物理标记、出版物以及拟南芥研究社区的信息。基因产物功能数据每周都会根据最新发表的研究文献和社区数据提交进行更新。TAIR 还在其数据页面上提供了广泛的链接,指向其他拟南芥资源。

https://www.arabidopsis.org/    #官网
https://www.arabidopsis.org/download/list?dir=Proteins    #直达蛋白序列

然后下载两个版本的蛋白质组就可以了。

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