Illumina测序为什么读长上不去？

Illumina测序为什么读长上不去？

X-Omics

生物科学与计算机科学的完美碰撞，激发出探索世界的全新视角。

1 人赞同了该回答

Illumina测序平台之所以读长上不去，主要有以下几个原因：

1. 信号强度降低：随着读长的增加，每个碱基所对应的信号强度会变得越来越弱，导致信噪比下降，从而降低了测序的精度和可靠性。
2. 错误率增加：随着读长的增加，测序过程中出错的概率也会随之增加，导致错误率上升。
3. 测序效率下降：随着读长的增加，测序过程中需要的反应时间和试剂成本也会增加，同时也会增加数据处理和存储的难度和成本。
4. 序列重复性下降：随着读长的增加，序列的复杂度会下降，使得序列的重复性增加，从而影响到测序结果的质量。

尽管Illumina测序平台的读长上限较低，但是其高通量、高精度、低成本的特点，使其成为现代基因组学研究中最常用的测序平台之一。同时，随着技术的不断发展和改进，未来Illumina测序平台的读长上限也有望得到进一步提高。

Illumina测序的读长受到多种因素的影响，包括测序仪器的技术限制、测序反应的物理化学特性、测序文库的制备方法等。目前，Illumina测序的读长已经达到了PE300左右，但是要进一步提高读长仍然面临很多技术挑战。一方面，需要改进测序仪器的技术，提高其读长和准确性；另一方面，需要改进测序反应的物理化学特性，提高其信噪比和准确性；此外，还需要改进测序文库的制备方法，提高其DNA片段的长度和质量。总之，提高Illumina测序的读长是一个复杂的技术问题，需要多方面的努力和创新。