主要利用RDKit
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem import AllChem
mol=AllChem.MolFromPDBFile('mol.pdb')#将pdb表示分子转换为mol对象
molSmiles=Chem.MolToSmiles(mol)#将mol对象转换为smiles
主要利用RDKit
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem import AllChem
mol=AllChem.MolFromPDBFile('mol.pdb')#将pdb表示分子转换为mol对象
molSmiles=Chem.MolToSmiles(mol)#将mol对象转换为smiles