伪时序分析词汇（三）

1. 假阴性错误（false-negative errors）:
   高水平的基因可能偶尔没有检测到

2. 假阳性错误（false-positive errors）:
   低水平表达的基因由于扩增偏差，可能显得过于丰富，导致假阳性错误

3. 批量效应（batch effect）：
   当实验设计不当的时，数据结果会显著受到批量效应的影响。
   批量效应是指在不同条件下测量总体产生不同的性质，且与研究中的生物或者科学变量无关。例如在周一运行一组实验，在周二运行另一组实验，或者两个技术人员负责不同的实验，或者使用两种不同批量的试剂，芯片，仪器，可能会出现批量效应。

4. 流形假设（manifold hypothesis）:
   通常假定现实世界的高维数据位于嵌入在高维空间的低维流形上，这被称为流形假设。
   假定数据是嵌入到高维空间的低维流形采样，流形学习的目的是恢复数据的低维表示结构。

5. 本征维度（intrinsic dimensionality）:
   数据的本征维度是在考虑到数据观测属性所需的最小参数个数。换句话说，本征维度是用于表示原始数据嵌入流形的最小维度。
   理想情况下，降维后的表示维度应该对应于数据的本征维度。

6. ground truth :训练集认为100%准确的标签(人工标注的结果)