TRANSFAC:转录因子及其靶基因数据库

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转录调控是一种重要的调控机制，转录因子对基因的表达调控是其中研究的最广泛的一个领域。研究转录因子，最经典的数据库就是TRANFAC数据库，网址如下

http://gene-regulation.com/

该数据库中不仅收录了转录因子和对应的家族信息，也收录了转录因子调控的基因以及转录因子结合位点TFBS等信息。该数据库有以下两个版本

1. Professional

2. Public

两个版本的比较如下

public版本是免费开工的，但是收录的数据少很多，而且2005年之后就不在更新了。Professional数据多，功能强大，但是收费的。

虽然两个版本数据量不同，但是数据的组织和展示形式是一样的，可以通过Public来了解下其中的信息，使用public数据库是需要登录的，登录之后，可以看到如下的检索页面

public版本中，将转录因子相关信息进行了分类整体，共分成以下6种类型

• Factor

• Class

• Matrix

• Site

• Cell