miRWalk:综合型的miRNA靶基因数据库

欢迎关注”生信修炼手册”!

miRWalk是一个综合性的miRNA靶基因数据库,收录了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,和mirDIP类似,也是一个整合型数据库,整合了来自miRDB, TargetScan, miRTarBase等数据库中的信息,网址如下

http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/

该数据库中共包含以下5个物种的miRNA靶基因信息

  1. human

  2. mouse

  3. rat

  4. dog

  5. cow

官网提供了两种检索功能

1. 一次检索一个miRNA/gene

检索框如下

对于miRNA, 支持mirBase数据库中的ID和编号,也支持miRNA family的名字。

对于Gene, 支持gene symbol, Entrez Id, Ensembl-ID等多种格式,也支持输入对应的转录本ID, 比如RefseqEnsembl数据库中的转录本ID。

检索结果如下所示

页面非常简洁,只有一个结果下载的功能。

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值