DNA甲基化与表观遗传学数据挖掘与分析学习会（10月26-27 上海）

最新推荐文章于 2021-09-23 20:38:00 发布

刘永鑫Adam

最新推荐文章于 2021-09-23 20:38:00 发布

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两天一夜高强度训练，理论与实战相结合

赠送高清视频供学员复习使用

会务背景

表观遗传学调控多种生命活动及疾病发生发展，已成为近年来生命科学领域的研究热点，促使了生物学多领域研究的突破性进展。随着实验和测序技术的进步，当前产生了海量的表观基因组数据，从这些数据中挖掘生物学特征对理解生命的生理及病理过程有重要意义。面对海量的数据包括DNA甲基化谱、组蛋白修饰谱、染色体开放信息等，研究人员开发了针对不同数据的分析工具和策略，理解和掌握表观基因组数据的分析方法，有助于从事表观基因组研究领域的科研工作者深入挖掘疾病、发育和衰老等重要过程的调控机制，并为进一步开展实验和临床应用研究提供潜在靶标。应广大单位和科研院所要求，我们特开设本班，为广大研究者提供科研助力。

本班特色

1、理论结合实操；

2、案例讲解分析结合；

3、协助分析学员的实际数据

内容设置

第一天上午

8:30-

11:30

表观遗传学研究内容及思路，DNA甲基化原理、应用及研究

1. 了解表观遗传学的研究内容及调控机制。

2. 通过近期Cell文章理解表观遗传学文章图表和思路。

3. 了解高通量测序技术的原理和数据形式。

4. 了解表观遗传学各组学的测序技术及分析内容。

5. DNA甲基化作用机制及研究应用。

理论

第一天下午

1:30-

17:00

Linux及R语言实操，DNA甲基化数据分析

1. 常用Linux命令入门讲解及实操训练。

2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用。

3. R语言语法介绍及常用命令。

4. 数据处理功能及统计应用。

5. DNA甲基化测序数据分析（bismark，methylKit等软件）。

6. DNA甲基化芯片数据分析（IMA等软件）。

实操

第一天晚上

18:00-21:00

组蛋白修饰、ATAC、表观转录组测序技术、分析思路及流程

1. 组蛋白修饰和ATAC的研究方法及技术发展。

2. 组蛋白修饰和ATAC的研究内容及科研思路。

3. 组蛋白修饰及ATAC数据的分析流程及绘图。

4. 组蛋白和多组学数据的整合分析。

5. 表观转录组学研究内容及多组学整合思路。

理论

第二天上午

8:30-

11:30

组蛋白修饰、ATAC数据分析，

组学常用数据库使用

1. 利用fastqc、cutadapt及Trimmomatic对原始数据进行质控。

2. 通过bowtie2、bwa等软件进行基因组mapping。

3. 通过MACS2软件进行peak calling。

4. 利用HOMER软件进行peak注释及motif分析。

5. 调用R语言包Diffbind进行差异peaks分析。

6. 常用表观组学及疾病挖掘数据库介绍及使用

实操

第二天下午

1:30-

17:00

mRNA及非编码RNA分析及图形绘制

1. 转录组数据分析内容及研究思路。

2. 长非编码RNA、microRNA及circRNA的研究方法及思路。

3. 转录组多组学整合分析思路和案例介绍。

4. 通过tophat2、hisat2软件进行转录组数据mapping。

5. 通过HTSeq及featureCounts进行基因表达定量。

6. 通过Deseq2，edgeR等R语言包进行差异表达分析。

7. 应用DAVID及metascape网站进行通路富集分析。

8. 箱型图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。

9. 归纳总结零成本表观组学数据挖掘思路。

10. 表观遗传基金申请思路、准备内容及注意事项等。

理论+实操

其他事宜

【主办单位】

玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）

【承办单位】

上海玮瑜生物科技有限公司

【时间地点】

时间：2019年10月26-27日 25日报到

地点：中国上海田林宾馆田林路1号

【住宿说明】

田林宾馆 380元-450元/标间费用自理

【会务费用】

3400元/人。授课期间发放纸质邀请函（盖章）和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐，晚餐自理。

【指定账户】

A：银行转账

户名：上海玮瑜生物科技有限公司

账户号：97340154740007035

开户行：上海浦东发展银行大华支行

B：支付宝转账

收款人：wybiot@163.com

支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司

C：现场刷卡或现金：支持公务卡

说明：汇款时写上您的姓名，如果朋友代付一定要注明您本人的名字，便于好查询。

【联系人】

联系人：谢老师 13611825136

指定报名邮箱： wybiot@126.com

【报名方式】（推荐在线报名）

1.邮件和信息报名：请您将您的姓名发信息到13611825136或wybiot@126.com。工作人员会联系您！

2.扫码在线报名（扫码下面的二维码在线报名）

其他课程安排，

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10.19-20	北京	中药复方sci论文如何突破5分大关
10.19-20	北京	不做实验不写meta 如何发文章（临床预测模型类论文）
10.26-27	上海	DNA甲基化与表观遗传学数据挖掘与分析
10.26-27	上海	TCGA、GEO及SEER公共数据库挖掘与应用
11.2-3	上海	影像组学应用与SCI论文写作学习会
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11.7-10	上海	系统评价与meta分析
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