生物信息百jia软件（25）：quast

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去年这时候制定了一个计划，写100篇生物软件的教程推文，取名字“生物信息百jia软件”，本来以为很快就可以完成，结果没想到由于各种事情，这项计划给搁浅了，只完成了四分之一，半途而废不是我性格，所以，接下来我们继续。当你熟悉Linux操作，熟悉测序原理之后，这部分内容使用起来将异常容易。
应用场景
1、得到不同软件拼接的基因组序列，想比较一下哪个软件拼接效果更好；
2、同一软件，比较不同选项参数拼接的结果，哪个更好；
3、比较拼接得到的基因组，与参考序列的相似性。

软件官网
QUAST: Quality Assessment Tool for Genome Assemblies
QUAST：http://bioinf.spbau.ru/quast
http://quast.sourceforge.net/quast

参考文献
Alexey Gurevich, Vladislav Saveliev, Nikolay Vyahhi and Glenn Tesler,
QUAST: quality assessment tool for genome assemblies,
Bioinformatics (2013) 29 (8): 1072-1075. doi: 10.1093/bioinformatics/btt086
First published on