穿膜肽相关——计算机模拟部分

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穿膜肽（CPP）

穿膜肽数据库（CPPsitee2.0）已经检索超过1800个穿膜肽。

穿膜肽可以将各种生物活性分子递送到细胞内。

穿膜肽简单分为3类

阳离子型肽、两亲性肽和疏水性肽。

阳离子穿膜肽主要在生理pH条件下具有高真电荷的多肽，其中正电荷主要来源于精氨酸和赖氨酸。

精氨酸残基比赖氨酸对细胞内化的贡献更大。这归因于精氨酸的胍基基团能够和细胞膜成分中带负电荷的羧基、硫酸基和磷酸基团形成氢键，导致CCPs在生理pH条件下的细胞内化。

两亲性穿膜肽包含极性和非极性区域，除了带正电荷的赖氨酸和精氨酸外，还含有丰富的疏水残基。

疏水性穿膜肽......

穿膜肽Tat递送多种大蛋白或多肽，增强了大分子药物的跨膜转运能力。

基于文献确定候选穿膜肽

该课题确定了6条典型的不同来源，隶属于3种类型的穿膜肽作为研究对象。

ＹＧＲＫＫＲＲＱＲＲＲ

#Tat(47-57),是目前研究和应用最多的一种阳离子穿膜肽。

ＲＱＤＯＷＦＱＮＲＲＭＫＷＫＫ

#来源于DNA结合蛋白的penetratin，同样是一种阳离子穿膜肽。

 ＫＥＴＷＷＥＴＷＷＴＥＷＳＱＰＫＫＲＫＶ #Pep-1

ＬＬＨＬＲＲＲＩＲＫＱＡＨＡＨＳＫ #pVEC

#这两者都是一级结构两亲型的两亲性穿膜肽。


 ＲＲＩＲＰＲＰＰＲＬＰＲＰＲＰＲ #Bac7

#两亲型穿膜肽，富含脯氨酸。

 ＣＳＩＰＰＥＶＫＦＮＫＰＦＶＹＬＩ－ＮＨ２ 
#C105Y，是常见的疏水性穿膜肽。