Windows-安装infercnv包（自备）

目录

安装基础

①安装JAGS

a,找到适配版本

b，install for me only安装路径

②安装"rjags"包

③安装inferCNV

安装基础

版本：
R version 4.2.2 (2022-10-31 ucrt) -- "Innocent and Trusting"
 
安装的JAGS版本为JAGS 4.3.1

首先是安装所需配置的环境和包：

①安装JAGS（环境变量）

②需要"rjags"包

③安装inferCNV

解决思路：找到对应R版本的JAGS进行安装，使rjags包能够加载，然后安装使用inferCNV。一定要对应相适配的版本。

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①安装JAGS

a,找到适配版本

JAGS: Just Another Gibbs Sampler download | SourceForge.net

一定注意版本需要与R适配

我刚开始安装JAGS-4.3.0.exe报错: 不能进行链接

载入需要的程辑包：coda

错误: package or namespace load failed for ‘rjags’:

loadNamespace()里算'rjags'时.onLoad失败了，详细内容：

调用: inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...)

错误: 无法载入共享目标对象‘C:/Users/AppData/Local/R/win-library/4.2/rjags/libs/x64/rjags.dll’：:

LoadLibrary failure: 找不到指定的程序。

此外: Warning messages:

b,install for me only安装路径

这个详见infercnv中rjags或jags包安装问题及解决办法(windows演示)_infercnv包安装-CSDN博客

加载成功

#我没有使用代码连接
#Sys.setenv(JAGS_HOME="C:/Users/AAABBB/AppData/Local/JAGS/JAGS-4.3.0")

> library(rjags)
载入需要的程辑包：coda
Linked to JAGS 4.3.1
Loaded modules: basemod,bugs

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②安装"rjags"包

rjags包是cran的包，不能使用BiocManager::install安装

CRAN - Package rjags (r-project.org)

install.packages("rjags")

#不是BiocManager::install("infercnv")（这个错误）

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③安装inferCNV

最后安装安装inferCNV即可。

Bioconductor - infercnv

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
     install.packages("BiocManager")
4BiocManager::install("infercnv")

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感谢：

inferCNV安装报错 - 知乎 (zhihu.com)

如何解决rjags包加载时“LoadLibrary failure: 找不到指定的程序？”(语言-java)_编程语言-CSDN问答

 infercnv中rjags或jags包安装问题及解决办法(windows演示)_infercnv包安装-CSDN博客