本文介绍了在安装InferCNV包时遇到的依赖问题，特别是rjags包与JAGS库的安装。通过下载JAGS并配置环境变量，解决了R中调用rjags和infercnv包失败的问题。调用inferCNV包前需确保执行相关环境设置。
InferCNV是一个由broad研究所开发的，利用单细胞转录组数据分析肿瘤细胞拷贝数变异（CNV）的工具。基本思路是在整个基因组范围内，通过计算肿瘤细胞关于参考的“正常”细胞的相对表达，利用滑窗思想对邻近的基因相对表达，计算拷贝数。
先贴一个官方安装说明：
官方infercnv安装说明
安装infercnv包：
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager
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