PYMOL | 制作动画

1. 方法一：纯命令行

• 1.命令窗口输入mset 1 x30，定义一个30帧的动画；
• 2.输入frame 1定义第一帧；
• 3.调整分子到一个合适的观察角度；
• 4.输入mview store 存储该观察视角为第一帧;
• 5.输入frame 30 定义第30帧;
• 6.调整观察角度到另一个需要观察的角度;
• 7.输入mview store 存储该观察视角为第30帧；
• 8.输入mview reinterpolate创建从第一帧到第30帧的平滑过渡；
• 9.输入mplay观看播放效果；
• 10.输入 set ray_trace_frames=1 输出时渲染每一张图片；
• 11.输入set cache_frames=1
• 12.输入mpng mov输出30帧png图片(输出图片时一定要注意pymol当前工作路径在哪，因为图片会输出到当前路径下，不搞明白的话连图片保存到哪都不清楚)
  命令窗口输入pwd可以查看当前工作路径，cd命令可以改变当前工作路径，是不是感觉和linux终端一样？

输出的图片导入Pr制作动画

2. 方法二：图形界面操作

方法一固然可以制作动画,但不方便调整，只适用于制作短小简单的动画。当制作复杂动画时（呈现多个视角）如果想调整存储的不同视角呈现顺序则十分不便。下面介绍的第二种方法可以很好地应对这点不足。

2.1. 设置动画时长

可以看到下方出现了时间帧数进度条（3秒共90帧）。想调整帧率的话可以依次点击：
Movie >> Frame rate 。如果后续想延长动画时长，可以重复上述操作。

2.2. 调整视角，存储视角

可以看到左下角出现了三个视角的编号：001, 002, 003。

2.3. 分配上述制作的视角到时间轴

拖动时间进度条，在合适的位置分配“视角”。

如果想删除掉某个时间节点处的视角，可以右键选择clear。

2.4. 预览

点击右下角播放按钮：

2.5. 动画平滑处理

命令行输入：mview reinterpolate

2.6. 输出图片设置

命令窗口依次输入：
set ray_trace_frames=1
set cache_frames=1
mpng mov