使用bedtools merge合并有重复区间的bed文件

实际工作中， 在使用bcftools filter 获取某些区间的snp的时候，常常会由于bed文件中的区间相互有overlap而导致最终得到的结果中有重复的snp位点，这种情况下，我们就还需要去除重复位点，一种好的方法是在提取之前先对bed文件中的区间进行合并，合并的方法就是使用bedtools merge -i input.bed的方式。